第285章 這還是化學問題嗎(2/2)
「可能是我經常鍛鍊的緣故吧。」
「精神比較好。」
「另外我也想早點,把酶催化項目結題,實現工業革命的重塑。」
在深度睡眠等各項能力加持下,讓他相比較其他人有更多的學習時間,且把自律當成了一種正向反饋。
所以加班到這個時候,完全再正常不過。
至於其他人,也就只能在心裡崇拜。
把徐銘的話悉數聽進耳中,周啟深不由心中一動,下意識試探性詢問了句。
「關於蛋白質結構的初步設計,進行的怎麼辦了?」
「截止今天晚上,我們已經積累了兩千個初步設計,且目前和超算中心方面取得了聯繫,從明天開始就會正式開展第一輪篩選。」
徐銘沉聲講述道:
「藉助超級計算機的算力,能省去大量時間。」
在這高達兩千個初步設計方案中,其中絕大部分都無法得到想要的蛋白質結構。
如果單靠人力進行實驗來試錯,那麼無論科研經費還是研發周期,都會出現一個恐怖的數倍增長。
但藉助超級計算機和多尺度動態計算模型,則可以快速篩選掉一大部分設計。
然後再通過他對結果洞察,確定最符合學術條件的方案去具體實驗,若一切過程順利的話,那麼用不了多長時間就能得到理想蛋白質結構。
成功合成需要的人工酶。
感受著徐銘語氣中散發出的自信和胸有成竹,周啟深也不由得鬆了口氣。
身上自己給自己的壓力,頓時減輕許多。
「看來今晚我是來對了,真讓人期待啊!」周啟深臉上堆出燦爛笑容。
翌日。
徐銘同全體議題組員,接入超算中心會議室,把初步設計方案序列,輸入到模型的快速評估模塊。
「序列正在輸入。」
「篩選標準為,摺疊自由能低於-8.0千卡每摩爾,金屬簇結合能預測值低於-12.0,底物結合通道在分子模擬中至少保持開放10納秒。」
「計算開始。」
房間內兩地同步播報聲音響起,兩千個設計被轉化為數學模型。
在數字宇宙中經歷嚴酷的演化壓力。
有些序列理論上根本無法摺疊;有些能摺疊,但形成的口袋形狀偏離要求;有些雖能結合金屬簇,但靜電梯度完全錯誤。
伴隨著一個個設計被篩選出局,留下可行性最高的極少部分方案。
整個快速篩選共持續了十二個小時。
眾人一直待到了晚上九點,終於拿到篩選結果。
「徐院。」
「根據報告顯示,在所有設計中,有13個在100納秒模擬中保持了結構完整性。」
「金屬簇穩定結合,底物通道保持開放。」
路川強忍著心中劇烈的情緒波動,當著全體組員的面向徐銘匯報,關於超級計算機對設計的篩選結果。
在這13個通過篩選的設計中,很有可能就存在,實現酶催化所需的全新蛋白質結構。
關鍵僅用了半個多月時間,就走到了這一步,放到以前他參與項目時,可以說連想都不敢想。
偏偏徐銘將其變成了現實。
當然他非常清楚,之所以能快速篩選,要歸功於徐銘除數學和化學之外的信息算法水平,否則換成別人想把這些設計從兩千篩選到十幾個,花費幾年時間在數學界都是件很正常不過的事情。
甚至最終還得不到一個好的結果。
對於這份報告,周啟深同樣喜不勝收,下秒接過報告激動的搭話。
「可以開始合成了。」
「十三個序列,依次做密碼子優化,合成基因,構建表達載體。」
然就在他話音落下的同時,卻見位於主座的徐銘搖了搖頭提出不同意見。
「還是太慢了,要做二輪篩選。」
「二輪篩選?」周啟深眼神中流露出驚訝。
在他看來只是對十三個設計合成,所需花費的時間和實驗次數是能夠接受的,只要其中有一個設計,能通過最終的催化反應實驗,那麼便代表這項現代化學絕症,被徹底解決治療好。
結果徐銘則表示,還要在十三個設計基礎上,再次進行新一輪篩選。
徐銘口中的第二輪篩選,自然是由他來執行。
最好通過結果洞察,確認可行性最高的那個,直接省掉後面的合成。
念頭停留在這裡,徐銘也沒賣關子,直接用輕描淡寫的語氣進行回答。
「我會親自動手展開二輪篩選,給我幾天時間。」
「那好吧。」周啟深想了想果斷答應下來。
反正酶催化的研究,進展到這裡,已然能稱得上是無比高效。
多等上幾天並無影響。
不過他也沒指望,僅一次就可以成功,默默在心裡做出了依舊全部進行合成實驗的決定。
徐銘並未去研究其他人的想法,拿到那13個設計後便開始分析起來。
而結果正如他想的那樣,花費幾天時間後,他順利確認了一個可行性最高的設計。
並認為絕對能徹底攻克酶催化。
當把這唯一的一個設計,拿到周啟深面前時,對方震驚的嘴巴能塞進拳頭。
「你第二輪篩選,竟然否定了十二個設計?」
「是的。」
徐銘點點頭:「讓實驗室準備合成實驗吧,我相信我的判斷。」
「我明白了。」周啟深短暫怔神後快速反應過來,沒有在這件事上過多糾結。
接著立刻召集路川等化學所成員,針對徐銘最後篩選出來的設計方案,開始進行合成構建表達載體。
雖然大家心裏面實在難以置信,單純人力能把超算篩選後的設計再次篩選到僅剩下一個。
但工作起來卻絲毫不馬虎。
直接由周啟深和研究員組建的豪華團隊,親手負責起實驗室內的PCR儀和電泳槽等。
凝膠成像系統更是晝夜不停。
三天後。
基因順利完成合成,測序確認無誤。
表達載體構建,蛋白表達純化,所有步驟都在一周時間內完成。
進入七月份。
讓化學研究所和國際數學挑戰研究院,最激動和期待的時刻終於到來,即要對這項目標蛋白進行反應測試。
確定是否能達到預期催化效果,在如此短的時間內攻克酶催化。
千越南秋筆下的世界,盡在《這個學霸過於自律》。